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PubMed完全攻略


PubMed 完全攻略 转)[图] 完全攻略(转 图 第一章 进入 PubMed 魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸 福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题 时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上 3,4 个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他," 快的话,可能只要 3 秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后 面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如 果我们失去 PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于 PubMed 的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速 度等多方面因素而言, PubMed 都首屈一指。 还有非常重要的一点, 正如它的名字 (PubMed=Public+Medicine) 所 暗 示 的 , PubMed 是 免 费 向 公 众 开 放 的 。 无 论 何 时 何 地 , 你 只 要 在 浏 览 器 地 址 栏 中 输 入 : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ 就可以立刻进入 PubMed 的界面并开始享受 PubMed 所给你带来的无穷 便利。 俗话说, 喝水不忘掘井 人。PubMed 是美国国 家 医 学 图 书 馆 (NLM) 所属的国家生物技术 信 息 中 心 (NCBI)开 发 的因特网生物医学信 息检索系统, 位于美国 国 立 卫 生 研 究 院 (NIH)的平台上。有 不少西方人有在饭前 祈祷感恩的习惯, 不知 道我们是否也有必要 每次使用 PubMed 前都 感谢 NCBI 呢? PubMed 覆盖了全世界 70 多个国家 4300 多种 主要生物医学期刊的 摘要和部分全文。 其覆 盖的时间段也非常长, 早的可以追溯到 20 世纪 60 年代,通常而言,这已经足够早了,很少 有人会需要查阅在此之前的文献。当 然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与 PubMed 挂钩的出版商 会自动向 PubMed 提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文 章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于 PubMed,我们仍旧可 以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商 通过 PubMed 提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在 PubMed 上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述) 。 进 入 PubMed 的 主 界 面 后 , 首 先 映 入 我 们

眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如上图) 。这是 PubMed 的核心部分。大 部分工作, 我们只要利用这"一框五键" 检索框, ( Limit 键, Preview/Index 键, History 键,Clipboard 键和 Details 键)即可完成。 在主界面的左侧框(如左图) ,有: · Journal Browser 期刊浏览 · MeSh Browser 可以用它来分层流览 MeSH 表 · Single Citation Matcher 输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内

容。 · Batch Citution Matcher 用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries 这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在 4 个范围:治疗、诊断、 病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的 PubMed 查询方式) 3) Related Resources · Order Documents 可以使用户在当地得到文献的全文, 但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我 将在后面的有关章节中详述。 · Grateful Med 是对另一个 NLM 基于网络的查询系统的链接。Grateful Med 也提供 MEDLINE 的接入,并且 还有一些其他的数据库如 AIDSLINE、HISTLINE 等等。 · Consumer Health 提供与 MEDLINEplus 的链接,MEDLINEplus 是与消费者健康信息相关的国家医学图书 馆的网络节点。 · Clinical Alerts 此部分的目的是加快 NIH 资助的临床研究成果的发布。利用左侧框的这些服务,我们不仅 能够进行功能更加强大的检索,而且还能得到不少非常有用的服务。这些都将在后续章节中介绍。 总体而言,PubMed 的界面相当简洁清晰,几乎是傻瓜式的。 然而傻瓜式的界面并不意味着傻瓜式的操作。我看到很多人用了几年的 PubMed,还是只知道在检索框里输 入一个关键字,然后按一下"Go"按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况,这样的操作 就足以得到令人满意的信息,但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所需的信息湮没在大量 纷繁芜杂的"无用"信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。 令人费解的是,很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间,却不愿花上几个小时的时间去认真 研究一下 PubMed。"君欲善其事,必先利其器", PubMed 就好像一把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于 知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及 至。 在以后的章节中,我们将逐步深入地了解 PubMed,相信通过这些章节的学习,我们可以真正熟练掌握 PubMed,从而使自己的工作事半功倍。 第二章 PUBMED 简单检索技巧 一.在这一章里,我们将对如何应用 PUBMED 这一得力助手检索文献, 作以简单介绍。 1.当你打开浏览器,在地址栏内键入 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ 或是 http://www.PubMed.gov/后, 就进入了 PUBMED 检索系统主页,可以见到如下的页面。

2.在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。 在检索框中输入查询词,然后单击"go"按钮或按回车键,PubMed 将会自动开始检索,并将检索到的相关条 目显示在屏幕上。在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除 NCBI 的数据库以外,可 供选择的还有:PROTEIN, STRUCTURE, POPSET 等等。 说到这里,很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符然后回车一敲便可万事大吉,其实不然。每个人搜 索效率的高低往往存在很大差别。在这里提供以下建议仅供读者参考: ? 明确你索要检索的关键概念及词语,即关键字; ? 考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词; ? 通过限定 DATES, STUDY GROUP 等,精炼你的检索范围; ? 多向有经验的人求教,因为不同的专业背景以及个人的差异,都有可能形成不同的方法和技巧。 3.通过布尔(BOOLEAN)运算来提高你的效率 最常用的三种布尔运算即是 AND,OR,和 NOT。 ? AND 提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪,只要他们都出现在索引文章的某 一处,就将其列出。 ? 而 OR 则是将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有 效。 ? NOT 运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意,会有可能将 一些你所需要的文章漏掉。比如当你的检索词为 LEAD POISONING NOT CHILDREN 时,除了会删除掉那 些仅讨论儿童的文章,同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章。 4.PUBMED 检索类型 通常我们所要查询的单词类型大致可以分为: ? 词语(主题)检索 这时我们在 PubMed 主页的检索框中键入的是英文单词或短语(大写或小写均可) 。 然后回车或点击"Go", PubMed 即使用其词汇自动转换功能进行检索, 并将检索结果直接显示在主页下方。 例如:键入"vitamin c common cold"后回车或点击"Go", PubMed 开始检索并将检索结果显示出来。 ? 著者检索 当我们所要查询的是著作者时, 在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为: "著者姓 空格 名字首字母缩写",例如 smith ja,然后回车或点击 Go,系统会自动到著者字段去检索,并显 示检索结果。 ? 刊名检索 在检索框中键入刊名全称或 MEDLINE 形式的简称、 ISSN 号, 例如: molecular biology of the cell, 或 mol biol cell, 或 1059-1524,然后回车或点击 Go,系统将在刊名字段检索,并显示检索结果。 ? 日期或日期范围检索 可以在检索框中键入日期或日期范围,然后回车或点击 Go,系统会按日期段检索, 并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为 YYYY/MM/DD;如:1999/09/08 也可以不录月份和日子,如:2000 或 1999/12。 ? 检索期刊子集(辑) 检索的格式为:检索词 AND jsubseta,如:neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊 子库有 3 种: Abridged Index Medicus(有 120 种重要核心期刊)、 Dental 和 Nursing。 分别使用 jsubseta, jsubsetd, jsubsetn 进行限定。 ? 检索带文摘的记录 检索的格式为:检索词 AND has abstract, 如:liver cancer AND has abstract。要注意的 是在 1975 年前出版的文章,其 MEDLINE 记录中没有文摘。 ? 布尔逻辑检索 PubMed 系统允许使用布尔逻辑检索,只要在检索框中键入布尔逻辑运算符(AND,OR 或 NOT) 。具体使用时要注意的问题,详见上第 3 点所述。


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